贵由即位后，对拔都不来参加忽里台大会，耿耿于怀，再加上以前的旧怨，就要求拔都来朝见他，同时他也领军从和林向西行去。在拔都到达现新疆境内时，贵由暴卒。“定宗即位三年，西巡叶密尔河，拔都恐，来谒，至阿勒塔克山，闻定宗崩而止。”
黎东方先生在他的《细说元朝》中讲到：拔都到达新疆境内时，接到拖雷王妃送给他的一个消息。这消息告诉他，贵由可汗已经由和林动身，向西边走来迎接他，而且怀有不利于他的阴谋，叫他小心。拔都于是停下不走，作了种种预防贵由暗算的准备。其后，贵由在走到离拔都只有一星期途程时，忽然死去。他可能是被拔都所派，或拖雷的寡妇莎儿合黑塔泥所派的刺客杀死或毒死。
从拖雷死的这件事看，这是有道理的。元史载：“拖雷早卒，宪宗、世祖尚幼，事皆决于后（拖雷王妃）。后有才智，能驭众，尤与太祖长孙拔都亲厚。太宗崩，与诸王大臣共立定宗，后主赏赍之事，优渥异常，故内外称善。”
由此看来，拖雷王妃因丈夫的死，一直心怀仇恨，早就想报复了。她不仅始终在笼络拖雷的老部下，而且察合台家族和窝阔台的一支，由于窝阔台汗位的原因，关系好，她指望不上，所以就联络了远在欧洲的、长子术赤的家族。
正是因为这缘故，在后来的忽里台大会上，拔都一力推举拖雷之子、忽必烈同母之兄蒙哥为汗。
初，太祖分部众于子弟，睿宗以幼子，所得独多，故诸将多睿宗旧部。睿宗卒，帝兄弟尚幼，事皆决于庄圣皇后。后有才智，能御众，又与拔都善，故众皆属意于帝。时又有建议者，谓拔都最长，当立，拔都不可。众曰：“王既不肯自立，请王审择一人，以定大计。”拔都曰：“吾国家幅员甚广，非聪明睿智、能效法太祖者，不可为主，我意在蒙哥。”众应曰：“然。”……议遂定。
但贵由可汗的王妃海迷失显然不同意，这次会议，她和察合台家族的人只派了两个代表前来，他们要求重新选举。拔都于是在第三年，于蒙古人的发祥地，斡难河与克鲁伦河的河源所在，又召集一次忽里台大会。
不仅如此，他还以他从欧洲带来的大军，武力威胁。“使其弟伯勒克、脱哈帖木儿将大军卫帝（蒙哥）而东，拔都自驻于西，以备非常。”
在这种情况下，窝阔台家族与察合台家族的人，都没有出席大会，贵由的王妃海迷失，干脆连代表也不派了。其实也是，这个时候，蒙哥当选可汗，已经是铁板钉钉了。
蒙哥即位以后，窝阔台的三个孙子失烈门、忽察与脑忽(贵由的儿子)来参加庆典，结果他们被逮捕、拷问，被迫自杀。蒙哥不仅逼死了这三人，还屠杀了他们的党羽。
既而，御者克薛杰上变，言：骡逸，自出追之，遇车马甚众。一车折辕，误以克薛杰为同行者，使助其缚辕。见车中有藏甲，讶而问之。御者曰：“尔车亦如此，何问为。”更问他车御者，乃知失烈门、忽察、脑忽三王欲乘宴会作乱。帝秘其事，命忙哥撒儿以兵逆之，止三五卫士，使各从二十人，献九白之贡。翌日，帝亲诘失烈门等，皆不承。考讯失烈门从官，始吐实，而自刭以死。复命忙哥撒儿穷治失列门等党羽太祖功臣也孙帖额、掌吉、爪难、合答、曲怜、阿里出等及野里知吉带之二子，皆坐诛，死者七十人，
蒙哥如此所为，虽有巩固大汗之位、打击政敌的意思，恐怕更多的是为了以前父亲拖雷的死，进行报复。但这使得黄金家族的子孙，彻底分为两个敌对的阵营：术赤与拖雷两支在一起，察合台的一支与窝阔台的子孙联合在了一起。
其后，术赤的钦察汗国与察合台汗国之间的争战，窝阔台的孙子海都与忽必烈的战争，都是因此原因。
但蒙哥登上汗位，还有一个人也出了力，那就是忽必烈。在忽里台大会上，“时大将野里知吉带自西域至，建议遵太宗之命，立失烈门。皇弟忽必烈作而言曰：‘太宗既欲立夫烈门，而汝等辅立定宗，岂太宗命耶？阿克塔隆为太祖爱女，即有罪，宜会诸王、哈屯定谳，乃不问而杀之，又岂太祖、太宗法耶？今日之事，奈何以太宗之命为辞！’闻者语塞。”
正是在蒙哥登上汗位的过程中，忽必烈有如此慷慨激昂的表现，所以后来蒙哥才把漠南、汉地的军政全交给了他。而这，恰恰为忽必烈打开了通向帝位的大门。
蒙古帝国大汗的位置，由窝阔台家族那里，转到了拖雷这一支的手里，是忽必烈登上帝国最高位置的必要条件，但这并不意味着汗位就该归他。但我们不要忘了，在他的身后，聚集了一批不甘寂寞，了解几千年权力斗争史的儒生，他们终究会粉墨登场的。正是他们，充当了忽必烈走向权力顶峰的充分条件。
如果忽必烈没有登上北元最高的权位，历史还会不会是原来哪个样子呢？我们璀璨的宋代文明陨落，该骂的人的确不少，但他们，所谓的儒生，就不该被骂一骂？